Les perturbations du microbiote, l’inflammation et le système immunitaire
Le microbiote intestinal est composé de milliards de micro-organismes (bactéries, virus, champignons). Il joue un rôle clé dans la santé digestive et immunitaire.
Quand l’équilibre du microbiote protège la santé
Lorsqu’il est équilibré, le microbiote :
- soutient la barrière intestinale,
- empêche la prolifération de pathogènes,
- régule les réponses immunitaires.
Mais lorsqu’un déséquilibre survient — appelé dysbiose — les conséquences peuvent être graves, favorisant l’inflammation chronique et l’affaiblissement de l’immunité.

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1. Perturbations du microbiote et inflammation systémique
La dysbiose peut être causée par différents facteurs : antibiotiques, alimentation déséquilibrée, stress ou infections.
Altération de la barrière intestinale
La barrière protectrice formée par les entérocytes et le mucus devient plus perméable (leaky gut).
Des molécules pro-inflammatoires comme les lipopolysaccharides (LPS) passent alors dans le sang.
Déclenchement d’une inflammation systémique
Les LPS et autres métabolites toxiques stimulent les cellules immunitaires, provoquant la libération de cytokines pro-inflammatoires (TNF-α, IL-1β, IL-6).
Cette inflammation de bas grade se propage dans tout l’organisme.

Conséquences possibles
- Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI),
- Diabète de type 2,
- Maladies cardiovasculaires.
2. Rôle du microbiote dans la première ligne de défense immunitaire
Le microbiote participe directement à la défense contre les agents pathogènes.
Barrière physique et chimique
- Les entérocytes, jonctions serrées et mucus intestinal bloquent l’entrée des pathogènes.
- Les cellules de Paneth produisent des peptides antimicrobiens.
Compétition avec les pathogènes
Les bactéries commensales occupent l’espace et consomment les ressources, empêchant les microbes nuisibles de s’installer. Elles produisent aussi des bactériocines, qui inhibent les pathogènes.
Régulation du système immunitaire
Le microbiote « éduque » l’immunité dès la naissance. Certaines bactéries, comme les Segmented Filamentous Bacteria (SFB), stimulent les lymphocytes Th17 qui recrutent les neutrophiles pour combattre les infections.

Production de métabolites bénéfiques
Les bactéries commensales fabriquent des acides gras à chaîne courte (AGCC), comme le butyrate.
Ils renforcent la barrière intestinale, réduisent l’inflammation en inhibant la voie NF-kB et soutiennent l’activité immunitaire.
En cas de dysbiose, tous ces mécanismes s’affaiblissent :
- la barrière devient poreuse,
- les pathogènes prolifèrent,
- l’inflammation chronique s’installe.
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3. Conséquences d’une dysbiose non traitée
Une dysbiose persistante peut :
- affaiblir les défenses immunitaires et favoriser les infections,
- contribuer à des maladies auto-immunes ou inflammatoires (MICI, arthrite),
- perturber l’équilibre métabolique, augmentant le risque d’obésité et de diabète.
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Restaurer l’équilibre du microbiote : une priorité santé

Pour limiter l’inflammation et renforcer l’immunité, il est essentiel de rééquilibrer son microbiote.
Cela peut passer par :
- une alimentation adaptée (fibres, aliments fermentés),
- l’apport de prébiotiques et probiotiques,
- une meilleure gestion du stress et un mode de vie sain.
En protégeant votre microbiote, vous soutenez vos défenses immunitaires et réduisez les risques liés à l’inflammation chronique.





