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Conseils santé & bien-être

Vous attrapez tout ce qui passe ? Le lien entre microbiote intestinal et immunité

Vous attrapez tout ce qui passe ? Le lien entre microbiote intestinal et immunité

Publié le
30 septembre 2026
Mis à jour le:
30 septembre 2026
Lecture :
9 min
Dans cet article :

Chaque hiver, c’est la même histoire. Un rhume qui s’installe, une gorge qui gratte, une fatigue qui ne lâche pas. Autour de vous, certains s’en tirent avec un mouchoir ; vous, vous enchaînez.

Vous avez essayé la vitamine C, le repos, les tisanes. Ça aide, un peu.

Ce que l’on regarde moins souvent, c’est le rôle de l’intestin dans l’immunité. Car notre tube digestif n’est pas seulement un organe de digestion : c’est aussi l’une des plus grandes interfaces entre notre organisme, le monde extérieur, notre microbiote et notre système immunitaire.

À retenir

L’intestin, l’un des principaux organes de notre système immunitaire

On lit souvent que 60 à 70 % du système immunitaire se trouverait dans l’intestin.

L’idée derrière ce chiffre est juste : l’intestin concentre une activité immunitaire considérable.

Le pourcentage précis, lui, est plus difficile à défendre scientifiquement comme une valeur universelle. Les méthodes permettant de compter « toutes les cellules immunitaires du corps » ne permettent pas d’aboutir à un chiffre unique applicable à chacun.

Ce que l’on peut affirmer plus solidement, c’est que l’intestin constitue le plus grand organe immunologique muqueux de l’organisme. Des travaux classiques estiment par exemple qu’il contient 70 à 80 % des cellules productrices d’immunoglobulines.

Et ce n’est pas un hasard.

C’est là que votre organisme rencontre quotidiennement une quantité considérable d’éléments venant du monde extérieur : aliments, molécules alimentaires et microorganismes.

La paroi intestinale est donc un véritable poste-frontière.

santé microbiote

Elle doit accomplir deux tâches contradictoires :

  • laisser passer les nutriments dont nous avons besoin ;
  • empêcher le passage incontrôlé d’agents potentiellement dangereux.

Autrement dit, le système immunitaire intestinal ne doit pas seulement savoir attaquer.

Il doit surtout savoir distinguer ce qu’il faut tolérer de ce qu’il faut combattre.

L’intestin produit chaque jour une quantité considérable d’anticorps

Cette activité immunitaire se mesure notamment à travers les immunoglobulines A sécrétoires, ou IgA.

La muqueuse intestinale contient la plus grande population de plasmocytes producteurs d’anticorps de l’organisme.

Chez l’être humain, plusieurs grammes d’IgA sont sécrétés chaque jour dans l’intestin.

Ces anticorps participent à la première ligne de défense des muqueuses intestinales : ils interagissent avec les microorganismes, les toxines et les bactéries commensales.

On retrouve également des IgA sur les autres surfaces muqueuses, notamment respiratoires.

Les différents compartiments du système immunitaire muqueux communiquent entre eux, mais l’immunité respiratoire dépend elle aussi de ses propres tissus et de nombreux autres mécanismes.

bactéries qui n'arrivent pas vivantes​ - microbiote

L’idée importante est ailleurs :

l’intestin n’est pas isolé du système immunitaire. Il en constitue l’un des centres d’activité les plus importants.

Microbiote et immunité : comment nos bactéries entraînent-elles nos défenses ?

Vos défenses ne naissent pas entièrement prêtes à l’emploi.

Elles apprennent.

Et l’une de leurs écoles est le microbiote : les milliers de milliards de microorganismes qui colonisent notamment notre côlon.

Cette interaction commence très tôt dans la vie.

La flore intestinale, deuxième cerveau

Les contacts entre le microbiote intestinal et les cellules immunitaires participent à la maturation du système immunitaire et à l’apprentissage de la tolérance envers les microorganismes commensaux et certains éléments inoffensifs de notre environnement.

Le microbiote est l’une des écoles du système immunitaire.

La diversité microbienne joue un rôle important, mais il n’existe pas une composition universelle du « microbiote parfait » permettant de prédire directement la qualité des défenses d’une personne.

Le microbiote constitue aussi une barrière contre certains microorganismes

La flore joue également un rôle beaucoup plus direct.

equilibre du microbiote protège la santé​

Lorsqu’un écosystème microbien est déjà bien implanté, les microorganismes qui le composent :

  • occupent des niches écologiques ;
  • consomment des nutriments ;
  • produisent différentes substances ;
  • interagissent avec l’épithélium et les cellules immunitaires.

Tout cela peut rendre l’installation de certains microorganismes pathogènes plus difficile.

Ce mécanisme porte un nom :

la résistance à la colonisation.

C’est l’une des fonctions bien documentées du microbiote intestinal.

Les antibiotiques illustrent particulièrement bien ce phénomène : lorsqu’ils perturbent fortement certaines populations bactériennes, la résistance à la colonisation peut diminuer et laisser davantage d’espace à certaines espèces opportunistes.

Microbiote, fibres et immunité : le rôle des acides gras à chaîne courte

Le microbiote ne se contente pas d’occuper de l’espace.

Il transforme ce que nous mangeons.

Certaines fibres qui atteignent le côlon peuvent être fermentées par les bactéries intestinales.

La flore intestinale : votre « deuxième cerveau » et le siège principal de votre immunité​

Cette fermentation produit notamment :

  • de l’acétate ;
  • du propionate ;
  • du butyrate.

Ces acides gras à chaîne courte interagissent à la fois avec la barrière épithéliale et le système immunitaire local et systémique.

Le butyrate constitue notamment une source énergétique importante pour les cellules du côlon et intervient dans différents mécanismes impliqués dans l’intégrité de la barrière intestinale.

Cela crée une chaîne particulièrement intéressante :

Alimentation → fibres → microbiote → métabolites → barrière intestinale et immunité

Infographie PhytoQuant présentant le rôle du microbiote, de la barrière intestinale et des IgA dans le fonctionnement du système immunitaire.

Une barrière intestinale altérée peut-elle perturber l’immunité ?

La paroi intestinale n’est pas un mur hermétique.

C’est une barrière sélectivement perméable, composée notamment d’une couche unique de cellules épithéliales reliées entre elles par différents systèmes de jonctions.

Lorsque la gélule est ouverte, elle peut être mélangée à des huiles végétales ou de l’eau. Par exemple, dans le cas d’une lésion cutanée, vous pouvez appliquer un mélange d’huile végétale et une gélule de chlorophylle magnésienne sur la zone concernée.

scientifique analysant télomères

Cette augmentation de perméabilité est observée dans plusieurs pathologies digestives ou inflammatoires. Mais la relation de cause à effet reste souvent complexe : une inflammation peut altérer la barrière, et une barrière altérée peut à son tour contribuer à certains phénomènes inflammatoires.

Infections à répétition et intestin : quels signes doivent faire réfléchir ?

Si vous enchaînez les infections respiratoires, aucun symptôme digestif ne permet à lui seul de conclure que votre microbiote en est responsable.

femme souffrant de gastrite

Mais certains contextes peuvent justifier de regarder également du côté digestif :

  • vos troubles digestifs ont commencé après une antibiothérapie ;
  • votre transit a changé durablement ;
  • vous souffrez régulièrement de ballonnements ou d’inconfort intestinal ;
  • votre alimentation est devenue très pauvre en fibres et très peu diversifiée ;
  • une infection ou une antibiothérapie a été suivie d’une perturbation digestive prolongée.

En revanche, une fatigue persistante, des infections particulièrement fréquentes ou sévères, une perte de poids inexpliquée ou des symptômes qui durent nécessitent une évaluation médicale.

Le microbiote ne doit pas devenir l’explication automatique de tous les symptômes.

Comment prendre soin de son microbiote et de son immunité avant l’hiver ?

Il n’existe pas de « cure magique d’automne » qui programmerait le système immunitaire pour tout l’hiver.

Mais l’automne peut être un moment pratique pour remettre à plat plusieurs habitudes avant la période où circulent davantage de virus respiratoires et où l’exposition solaire diminue.

1. Commencer par l’assiette

Reprendre de bonnes habitudes et un regime equlibre
  • Des fibres pour nourrir le microbiote.
  • Des légumes.
  • Des fruits.
  • Des légumineuses.
  • Des céréales complètes.
  • Des noix et des graines.

La qualité globale du régime alimentaire influence fortement la composition et surtout l’activité métabolique du microbiote.

Je supprimerais en revanche :

« Le sucre nourrit les opportunistes et fatigue les défenses. »

C’est trop simpliste.

L’enjeu est davantage de laisser suffisamment de place aux aliments végétaux riches en fibres et de limiter une alimentation dominée par des produits ultra-transformés, plutôt que de présenter le sucre comme nourrissant directement les « mauvaises bactéries ».

2. Dormir suffisamment

femme en train de dormir

Le sommeil n’est pas un détail.

Il existe une relation bidirectionnelle étroite entre sommeil, inflammation et réponse immunitaire.

Les perturbations chroniques du sommeil sont associées à une modification de différents paramètres immunitaires et à un risque accru d’infections dans plusieurs études.

Avant d’ajouter cinq compléments à une routine hivernale, récupérer suffisamment reste donc l’un des gestes les plus fondamentaux.


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3. Prendre en compte le stress

Le système nerveux, l’intestin, le microbiote et l’immunité communiquent en permanence.

stress et difficulté d'aller aux toilettes

Le stress chronique peut notamment influencer :

  • la motricité digestive ;
  • les habitudes alimentaires ;
  • le sommeil ;
  • certaines voies inflammatoires ;
  • et différents paramètres de la barrière intestinale.

Cela ne signifie pas que « le stress ouvre systématiquement l’intestin ».

Mais prendre soin du sommeil, de l’activité physique et des périodes de récupération contribue à une approche globale beaucoup plus solide que la seule prise d’un complément.

Les probiotiques peuvent-ils soutenir les défenses immunitaires ?

C’est une question plus intéressante qu’elle n’en a l’air.

La réponse n’est ni :

« oui, tous les probiotiques renforcent l’immunité »

ni :

« non, cela n’a aucun effet ».

Une revue Cochrane portant sur 24 essais et près de 7 000 participants a conclu que certains probiotiques pourraient diminuer modestement la fréquence de certaines infections aiguës des voies respiratoires supérieures et leur durée.

Mais le niveau de certitude variait de faible à modéré selon les critères étudiés.

Et surtout :

un résultat obtenu avec une souche probiotique ne peut pas être automatiquement attribué à toutes les autres.

scientifique analysant Quel est le lien entre l’intestin et le cerveau

L’effet d’un probiotique dépend :

  • de la souche ;
  • de la quantité ;
  • de la formulation ;
  • de la population étudiée ;
  • et de l’indication.

Un probiotique peut donc s’inscrire dans une approche du microbiote.

Il ne constitue pas à lui seul une assurance contre les infections hivernales.

Notre approche : le terrain d’abord, sans opposer intestin et micronutriments

La philosophie PhytoQuant reste simple : ne pas regarder l’immunité comme une fonction isolée.

Travailler sur le terrain intestinal et couvrir les besoins micronutritionnels sont deux approches complémentaires. L’une ne remplace pas l’autre.

Pour le microbiote : QuantaFlore Max

QuantaFlore Max apporte actuellement par gélule :

  • une sélection de 30 souches ;
  • 10 milliards d’UFC ;
  • 250 mg de fibre d’acacia Inavea™ PURE ACACIA ;
  • une gélule végétale gastro-résistante.

La recommandation actuelle est d’une gélule par jour, de préférence le matin à jeun, chez l’adulte et l’enfant à partir de 3 ans.

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QuantaFlore Max

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Nouveau : Probiotiques 10 milliards & 30 souches spécifiques. 

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Pour accompagner l’approche de la barrière intestinale : QuantaVilloSII

QuantaVilloSII associe actuellement, pour deux gélules :

  • 300 mg de L-glutamine ;
  • 160 mg de curcuma ;
  • 100 mg de butyrate de sodium ;
  • 2 milliards d’UFC de Saccharomyces boulardii ;
  • des OPC de vigne rouge ;
  • 40 mg de vitamine E.

La vitamine E contribue à protéger les cellules contre le stress oxydatif.

La recommandation actuelle est d’une gélule matin et soir, une demi-heure après les repas. Le produit est réservé à l’adulte et comporte plusieurs précautions d’emploi, notamment pendant la grossesse ou l’allaitement et avec certains traitements.

QuantaVilloSII

QuantaVilloSII

Inflammations & porosité des intestins. 

30,30 €
Voir le produit
Important

QuantaVilloSII est un complément alimentaire et ne constitue pas un traitement médical d’une pathologie de perméabilité intestinale.

Et les micronutriments et produits de la ruche ?

Une fois encore, il ne faut pas opposer les approches.

Vitamine D et immunité

Une chose est certaine au niveau réglementaire :

la vitamine D contribue au fonctionnement normal du système immunitaire.

QuantaVitD 2000 UI apporte actuellement 50 µg, soit 2 000 UI de vitamine D3 pour cinq gouttes.

QuantaVitD 2000 UI

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Vitamine D3 100% végétale concentrée à petit prix. 

12,30 €
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Cela ne signifie cependant pas qu’une supplémentation systématique prévient nécessairement les rhumes.

Une grande méta-analyse actualisée regroupant plus de 60 000 participants n’a pas retrouvé en 2025 de réduction statistiquement significative du risque global d’infections respiratoires aiguës avec la vitamine D par rapport au placebo.

La supplémentation doit donc d’abord répondre aux besoins et au statut de la personne, et non à la promesse de ne plus tomber malade.

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QuantaStimmun

QuantaStimmun associe notamment :

  • miel d’eucalyptus ;
  • pollen multifloral ;
  • propolis ;
  • échinacée ;
  • gelée royale fraîche ;
  • extrait de pépins de pamplemousse.

La formule actuelle est proposée en unidoses. La fiche produit indique une prise quotidienne et précise qu’en raison de l’échinacée, une utilisation prolongée en continu n’est pas recommandée.

QuantaStimmun

QuantaStimmun

Produits de la ruche pour soutenir l’immunité et mieux résister aux agressions.

40,10 €
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Important

En raison de la présence de produits de la ruche et d’échinacée, les personnes allergiques, celles atteintes de maladies auto-immunes ou prenant un traitement immunosuppresseur doivent respecter les précautions indiquées. Pour la grossesse, l’allaitement et chez l’enfant, demandez conseil à un professionnel de santé avant utilisation. La page actuelle de la Cure Défenses Naturelles formule également cette recommandation.

Une approche hivernale globale

Pour les personnes qui souhaitent regrouper ces différents axes, la Cure Prévention Hiver associe actuellement :

  • QuantaStimmun ;
  • QuantaFlore Max ;
  • QuantaPhylle.

Elle est conçue par PhytoQuant comme une approche combinant microbiote, alimentation/micronutrition et défenses naturelles.

Cure Prévention Hiver

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Renforce les défenses naturelles et aide l’organisme à mieux traverser l’hiver.

118,40 €
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Mais gardons l’essentiel en tête :

Important

aucune cure ne remplace le sommeil, une alimentation variée, l’activité physique, les vaccinations recommandées et une consultation médicale lorsqu’elle est nécessaire.

Ce qu’il faut retenir

L’intestin joue un rôle majeur dans l’immunité.

Mais pas parce que « toute notre immunité serait dans le ventre ».

Il s’agit d’un système beaucoup plus intéressant :

Microbiote → résistance à la colonisation
Fibres → métabolites microbiens
Barrière intestinale → contrôle des échanges
IgA et cellules immunitaires → surveillance et tolérance

L’ensemble communique en permanence.

Prendre soin de son microbiote fait donc partie d’une approche cohérente de la santé.

Mais un rhume fréquent n’est pas un diagnostic de dysbiose, et une dysbiose n’explique pas à elle seule toutes les infections hivernales.

nicola-frassanito-fondateur-phytoquant-monaco

Nicola Frassanito

Fondateur et CEO chez PhytoQuant

Nicola Frassanito, fondateur et PDG de PhytoQuant, expert passionné en herboristerie. Créateur de la marque de compléments alimentaires Phyto Quant en 2004, il conjugue sa passion pour les plantes à son omgagement pour la santé naturelle.

Questions fréquentes

Il est courant de lire que 60 à 70 % du système immunitaire serait situé dans l’intestin, mais ce pourcentage ne doit pas être considéré comme une mesure universelle précise. En revanche, l’intestin constitue l’un des principaux organes immunitaires de l’organisme et contient notamment la plus grande population de plasmocytes producteurs d’anticorps.

Oui. Le microbiote interagit avec les cellules immunitaires, participe à leur maturation, influence certains métabolites immunomodulateurs et contribue à la résistance à la colonisation par certains microorganismes pathogènes.

On ne peut pas établir une relation aussi directe. Un microbiote perturbé peut modifier certaines fonctions immunitaires, mais des infections respiratoires fréquentes ont de nombreuses causes possibles. Elles ne permettent pas de diagnostiquer une dysbiose.

Certains essais suggèrent que certaines souches probiotiques peuvent réduire modestement la fréquence ou la durée des infections respiratoires supérieures. Cependant, les résultats varient fortement selon les souches et plusieurs critères reposent sur des preuves de certitude faible à modérée.

Une alimentation variée comprenant légumes, fruits, légumineuses, céréales complètes, noix et graines apporte de nombreuses fibres utilisables par le microbiote. Leur fermentation produit notamment des acides gras à chaîne courte impliqués dans la physiologie de la barrière intestinale et de l’immunité.

Une augmentation pathologique de la perméabilité intestinale peut modifier les interactions entre contenu intestinal, épithélium et système immunitaire. Elle est observée dans plusieurs maladies. En revanche, on ne peut pas conclure qu’elle provoque directement une « immunité faible » ou des rhumes répétés chez une personne donnée.

Le sommeil et l’immunité sont étroitement liés. Des perturbations chroniques du sommeil sont associées à des modifications immunitaires et à une susceptibilité accrue à certaines infections.

Il n’existe pas de nécessité scientifique de suivre une « cure intestinale » chaque automne. En revanche, adopter avant l’hiver de bonnes habitudes durables — alimentation suffisamment riche en fibres, sommeil, activité physique et prise en charge des carences lorsqu’elles existent — est cohérent avec une approche préventive globale.

Les infections virales répétées sont fréquentes chez les jeunes enfants, particulièrement au début de la vie en collectivité. Si elles semblent anormalement fréquentes, sévères ou prolongées, ou s’accompagnent de difficultés de croissance ou d’autres symptômes, il faut en parler au pédiatre plutôt que d’attribuer automatiquement le problème au microbiote.

Publié le
30 septembre 2026​
Mis à jour le:
30 septembre 2026​